Sepanjang “perang browser” dengan Microsoft, Netscape meningkat secara signifikan selama munculnya Web Explorer. Pada bulan September 1995, versi 2.0 dari Netscape Navigator dirilis. Web Explorer primitif yang keluar untuk umum bulan sebelumnya tidak berada di dekat browser Netscape yang ditingkatkan. Sementara Web Explorer mengejar ketinggalan dengan fitur rilis Netscape Navigator tahun 1994, Netscape telah memasukkan fitur seperti applet Java, pengunggahan FTP, dan plug-in. Mungkin yang paling menonjol, Netscape Navigator 2 adalah browser pertama yang mendukung GIF animasi.
Namun, inovasi pada akhir Netscape bukanlah tandingan pembangkit tenaga listrik yang dulu dan sekarang adalah Microsoft. Karena Microsoft terus meningkatkan Web Explorer, ia segera menyusul Netscape Navigator. Semakin jauh berjalan, semakin baik Web Explorer sampai akhirnya sama bagusnya, jika tidak lebih baik di beberapa space, daripada Netscape Navigator. Web Explorer yang ditingkatkan digabungkan dengan kenyamanan sudah dimuat ke Home windows membuat gelombang berubah dengan cepat sesuai keinginan Microsoft.
Pada akhir bulan 1998, AOL mengumumkan pembelian Netscape dan kesepakatan tersebut kemudian ditutup pada tahun 1999. Kesepakatan tersebut bernilai $10 miliar. Pada akhir tahun 2003, AOL telah membubarkan Netscape. Iterasi browser Netscape terus-menerus dirilis oleh AOL, meskipun dikembangkan oleh staf AOL daripada tim Netscape. Nama Netscape Navigator kembali untuk satu rilis terakhir pada bulan Oktober 2007. Netscape Navigator 9 adalah versi terakhir dari browser, dan hanya memegang 0,6% dari pasar browser pada saat rilis. Dukungan untuk browser ini secara resmi dihentikan pada tahun 2008.